检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例 目录 下载平台文件 1.AnnotGPL参数改为TRUE,联网下载芯片平台的soft文件。（国内网速奇慢经常中断） 2.手工去GEO官网下载 转换...
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GEO数据挖掘 基因数据分析 生信分析 R GEO生信数据挖掘（二）下载基因芯片平台文件及注释
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GEO数据挖掘 R 基因数据分析 生信分析 GEO生信数据挖掘（四）数据清洗（离群值处理、低表达基因、归一化、log2处理）
检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例目录离群值处理删除 低表达基因函数归一化，矫正差异数据标准化—log2处理 完整代码上节围绕着探针ID和基因名称做了一些清洗工作，还做了重复值检查，...
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R GEO数据挖掘 基因数据分析 生信分析 GEO生信数据挖掘（八）富集分析（GO 、KEGG、 GSEA 打包带走）
第六节，我们使用结核病基因数据，做了一个数据预处理的实操案例。例子中结核类型，包括结核，潜隐进展，对照和潜隐，四个类别。第七节延续上个数据，进行了差异分析。 本节对差异基因进行富集分析。目录数据展示GO富集分析 -对基因名称...
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人工智能 GEO数据挖掘 基因数据分析 生信分析 R GEO生信数据挖掘（六）实践案例——四分类结核病基因数据预处理分析
前面五节，我们使用阿尔兹海默症数据做了一个数据预处理案例，包括如下内容：GEO生信数据挖掘（一）数据集下载和初步观察GEO生信数据挖掘（二）下载基因芯片平台文件及注释GEO生信数据挖掘（三）芯片探针ID与基因名映射处理GEO...
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生信分析 GEO数据挖掘 基因数据分析 GEO生信数据挖掘（一）数据集下载和初步观察
检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例目录GEOquery 简介安装并加载GEOquery包getGEO函数获取数据（联网下载）更换下载数据源对数据集进行初步观察处理GEOquery ...
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人工智能 生信分析 GEO数据挖掘 基因数据分析 GEO生信数据挖掘（五）提取临床信息构建分组，分组数据可视化（绘制层次聚类图，绘制PCA图）
检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例 上节做了很多的基因数据清洗（离群值处理、低表达基因、归一化、log2处理）操作，本节介绍构建临床分组信息。 我们已经学习了提取表达矩阵的临床信息...
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